反艦彈道導彈的主要攻擊目標是敵方航母編隊，按照美軍戰術條令，在中等威脅海域實施中、低強度作戰時，雙航母戰鬥群是航母編隊的典型編成，包括２艘航空母艦、１０－１２艘驅逐艦、２－４艘核潛艇、２∼３艘補給艦，其對抗反艦彈道導彈的主要手段是海基中段防禦系統（ＳＭＤ）。依據攜帶該系統的軍艦的部署位置，可以全程攔截彈道導彈，但主要是中段防禦。　　美國海基中段攔截系統（ＳＭＤ）已經開始部署，反艦導彈在實戰中必然面對敵方的攔截，為了增加突防成功率，有必要採取多種突防措施。目前常見的彈道導彈突防手段包括：　　飽和攻擊同時發射多枚導彈或攜帶多彈頭，超出防禦系統的攔截能力。　　誘餌欺騙通過使用誘餌，使防禦系統難以分辨出真目標，包括複製誘餌（大量與真彈頭目標特徵相近似的誘餌）、差異化誘餌（大量與真彈頭之間、彼此之間目標特徵均有一定差異的誘餌，從而使得防禦系統無法通過尋找目標特徵差異來判斷真彈頭）、反模擬誘餌（將真彈頭偽裝成誘餌）。