水轟-5配備于解放軍北航某水上飛機部隊。北航某水上飛行團曾經創下水轟-5連續飛行8.5小時的紀錄,與以往巡航4小時相比,作戰半徑成倍增長,遠程機動作戰能力大幅度提高。為實現創紀錄飛行,重點解決了機載雷達、通信、充氧等問題,並對放油系統、通氣系統、電路系統等進行了改進,進行了改裝到地面、空中放油試驗。