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華農科研人員繪製出陸地棉和海島棉的參考基因組
新華網  2018-12-05 11:44:08

  解碼棉花基因組能深入了解棉花種的起源進化及棉花重要農藝性狀形成的遺傳基礎,華中農業大學棉花遺傳改良團隊聯合海外研究團隊,共同解析了異源四倍體栽培種陸地棉和海島棉的參考基因組序列,為棉花基因組進化和功能基因研究提供了重要參考。國際權威期刊《自然-遺傳學》12月3日在線發表了這一最新研究成果。

  陸地棉和海島棉是當前棉花生産上主要使用的兩個異源四倍體栽培種,陸地棉産量高,適應性強,海島棉的産量低,但是其纖維品質比陸地棉優。雖然兩個棉花的基因組草圖已經發表,但是由於組裝品質和完整性不高,究竟哪些基因組片段控制海島棉優異纖維品質的形成等一直不清楚。

  為了得到精細的基因組序列,這項研究利用第三代測序技術、光學圖譜技術和染色質高級結構捕獲技術進行聯合組裝。與此前最新發表的基因組草圖相比,這項研究組裝的基因組序列,在連續性和完整性上有極大提高,陸地棉基因組、海島棉基因組的連續性分別提高了55倍、90倍。

  華農棉花遺傳改良團隊負責人張獻龍教授介紹,這項研究成功組裝了高度重復的基因組區域,通過比較兩個棉花四倍體種的基因組,發現二者存在大量的結構變異。兩個異源四倍體栽培種各有26對染色體,研究發現,兩個棉花種的14條染色體之間存在染色體臂內和臂間的大片段倒位現象,也就是説“兩個棉花種之間基因組差異很大”。

  為了基於棉花基因組的纖維遺傳改良研究,科研人員還對陸地棉和海島棉之間的遺傳導入係材料進行基因組分析,鑒定了13個控制纖維品質的遺傳位點,探究了遺傳位點的表達調控機制。這項研究為今後通過海島棉改良陸地棉的種間漸滲育種提供了參考。(新華社武漢記者李偉、俞儉)

編輯:蘇喜茹