原標題:我科學家發佈世界首個大規模小麥全基因組重測序研究結果
科技日報北京7月12日電(李曉春 王學鋒 記者 劉莉)7月12日,西北農林科技大學旱區作物逆境生物學國家重點實驗室在基因組學領域國際知名期刊Genome Biology上發表了題為《頻繁的種內和種間雜交塑造了普通小麥的遺傳多樣性》的論文,揭示了六倍體小麥遺傳多樣性來源於頻繁的與野生小麥的種內雜交及與更遠緣野草的種間雜交,為了解小麥起源、進化和馴化歷史,克服小麥遺傳資源同質化、促進小麥遺傳改良提供了重要的數據資源。
2016年底,西北農林科技大學加入國際小麥基因組測序聯盟(IWGSC),率先獲得內部共享的尚未發表的六倍體小麥參考基因組信息,開始對小麥遺傳多樣性來源這一重要命題開展了多學科、多團隊聯合攻關,對來自全世界的93個野生小麥、六倍體農家種和主栽品種開展全基因組重測序,面對高重復的多倍體基因組分析難題,通過開發新的分析流程,建立了全面的小麥變異組信息,揭示了全球最廣泛種植的作物——六倍體小麥各亞基因組的遺傳變異,群體內和群體間的遺傳分化程度,馴化和改良階段的受選擇信號等全方位的變異係譜和變異來源。
首個全基因組重測序研究提供了目前為止數量最多、覆蓋最全的六倍體小麥及其野生祖先的基因組變異集合,特別是篩選出來自多個野生小麥群體和遠源物種的大量基因滲入,其中一些滲入片段在群體中出現的頻率在馴化或是隨後改良過程中發生顯著增加。頻率改變並與已知數量性狀連鎖區域重疊,提示這些片段在馴化和改良過程中可能扮演著重要角色。相關結果有助於更深入理解小麥遺傳多樣性和進化歷程,同時為進一步挖掘影響多種小麥表型相對應的功能變異提供了寶貴資源。
博士生程紅、碩士生劉靖、溫佳和青年教師聶小軍為共同第一作者,姜雨教授、孫其信教授和宋衛寧教授為共同通訊作者。