國際在線江蘇頻道消息:3月26日,中國藥科大學基礎醫學與臨床藥學學院2018級藥理學專業博士生孫慶榮帶領其團隊“CPU-病毒組”成功開發了一個冠狀病毒資源數據庫(Coronavirus Resource Bank,簡稱“CRB”,網址為http://cov.cpu.edu.cn/)。這是一個專為冠狀病毒科研工作者開發的資源數據庫平臺,整合了目前國內外冠狀病毒的相關文獻資料、病毒相關數據以及病毒研究相關分析工具,旨在使廣大學者可以便捷迅速地查找冠狀病毒(包括新冠病毒)的相關研究文獻,深入了解冠狀病毒的起源、研究歷史、研究進程、研究熱點等,從而推動各領域科研工作者對冠狀病毒進行全方位、多角度的深層次研究和探討,促進藥學、化學、生物學等多學科的交叉融合。
中國藥科大學“CPU-病毒組”團隊全體成員 供圖 中國藥科大學
據了解,冠狀病毒資源數據庫儘管從建立到完善僅僅才32天,但數據庫中整合的文獻資源數卻不容小覷。截至3月22日,數據庫裏共收集了9556篇英文研究文獻、3052篇中文研究文獻、25個英文數據資源平臺、6個中文數據資源平臺以及18個與病毒學相關的主要分析工具等。
為了方便國內外科研工作者閱讀,孫慶榮團隊特意將數據庫頁面以中文和英文分別展示,清晰劃分為兩大板塊,即“國內冠狀病毒研究”和“國際冠狀病毒研究”。這兩大板塊下又設有多個子欄目,分別涵蓋了冠狀病毒發現至今的所有相關研究報告和綜述性論文、冠狀病毒所有數據資源系統(平臺)、與病毒學相關的分析工具以及冠狀病毒相關專利信息等。
孫慶榮在家遠程訪問數據庫伺服器 攝影 姜晨
數據庫中的研究報告和綜述性論文均以時間軸為核心編排展開,從最早的1965年起開始追蹤,直到2020年,時間跨度長達55年,方便科研工作者基於時間順序查閱相關文獻資料,快速了解冠狀病毒在每個年份的研究現狀和進程,以此追根溯源,深入探究。面對從20世紀60年代至今的海量文獻研究資料,孫慶榮團隊並不是簡單地進行全盤收納整合,而是剔除了一些評論性以及策略性文章,只保留了學術研究、學術綜述、病例解析、數據平臺、分析工具等相關內容,這樣能夠更好地集中有效學術資源,既精準覆蓋又全面科學,真正為冠狀病毒科研工作服務。
冠狀病毒資源數據庫平臺(CRB)首頁 供圖 中國藥科大學
當談及數據庫的開發初衷時,孫慶榮坦言,這一開發靈感主要來源於自己的導師。據了解,孫慶榮師從德國科學院院士、中國藥科大學校長來茂德。在疫情形勢嚴峻、各自居家隔離的情況下,孫慶榮與來自中國藥科大學藥學、臨床藥學、中藥學、生物制藥等多個專業的11位本科生迅速組建了“CPU-病毒組”團隊,大家一起查閱文獻、整理資料、搭建網站,開始了冠狀病毒資源數據庫的組建工作。孫慶榮通過對數據板塊合理的規劃,高效引領著團隊進行數據收集和整合。
未來,孫慶榮團隊將不斷對數據庫平臺進行資源更新,並加入更多數據分析以及與冠狀病毒相關藥物的數據資源。(文 姜晨 姜佳彤)