全球首個“萬種原生生物基因組計劃”在漢啟動
原標題:有水的地方,就有原生生物 全球首個“萬種原生生物基因組計劃”在漢啟動
12月30日,全球首個“萬種原生生物基因組計劃”在武漢啟動。該項目由中國科學院水生生物研究所聯合西藏大學、河南農業大學、中國農業科學院蘭州獸醫研究所、中國科學院北京基因組研究所和華中科技大學等單位共同發起。計劃在3年內,繪製萬種代表性原生生物基因組圖譜,建立一個大規模的原生生物遺傳資源數據庫。
原生生物主要是由單細胞真核生物組成的一大類群,包括單細胞真核藻類和原生動物等。“只要有水的地方,就有原生生物。”中科院水生生物研究所副所長、研究員繆煒介紹,目前已描述的原生生物物種數超過6萬種,未知種類更難以估量。然而,目前已公開發表基因組數據的原生生物僅400余種。
原生生物中的藻類貢獻了地球上近50%的光合行為,它們也是水産動物和人類的優良餌料和營養品;同時,原生生物中的部分甲藻和硅藻“瘋長”會造成河流和海洋的有毒藻華,帶來嚴重環境問題。此外,很多原生生物是人、畜禽和水産動物的重要致病性寄生蟲,如造成人瘧疾的瘧原蟲、昏睡病的錐蟲、雞球蟲病的球蟲等。
“這是國際上首次針對原生生物界的大規模基因組測序計劃。”中科院水生生物研究所副所長、研究員殷戰介紹,生物“五界”分為植物界、真菌界、動物界、原生生物界和原核生物,此前,國內外針對其他四界均啟動了大規模基因組測序計劃。而現在,從技術條件和科研實力上,我國科學家都具備了啟動原生生物界這一測序計劃的實力。
據悉,作為我國原生生物學發源地,水生生物研究所擁有一支在國內外有重要影響的原生生物學研究團隊,建有保藏了2500余種株真核藻類和近600種株原生動物的國家藻類和原生動物種質庫。近年來,依託原生生物基因組測序和生物信息分析平臺已完成500余種原生生物的基因組測序。
繆煒介紹,該計劃將依託各發起單位保藏的真核藻類和原生動物的種質資源,通過持續的樣品採集和宏基因組數據挖掘,在未來3年(2020年—2022年)完成約1萬種原生生物的基因組測序和分析,將包括原生生物全部26個門類,覆蓋超過85%的綱、60%的目和30%的科屬。該計劃將以開放聯盟模式運行,國內外有興趣的研究團隊均可加入。
與會專家認為,“萬種原生生物基因組計劃”的開展,將對理解生物多樣性形成機制、多細胞生物有性生殖的起源與演化等重大基礎生命科學問題,促進國家科技資源共享服務平臺的信息互聯互通,推動與生態環境保護、營養健康和疾病防治相關原生生物種質資源的挖掘與應用實踐具有重要意義。(湖北日報記者文俊、通訊員熊傑、孫慧)