港鐵為人流量最高的公共交通工具，每日接載數百萬計乘客，人口密集自然需要大量氧氣。港鐵在興建每個地下車站之前已設計至少兩組通風設施，以為乘客提供充足的空氣。
港鐵車務工程總管金澤培表示，通風口先將新鮮空氣從週邊抽入，經隔塵網過濾，由風櫃冷卻轉化為冷風，之後透過列車運行帶到車站每一個角落。
金澤培指出，港鐵每年都會量度車站的二氧化碳濃度一小時平均值，得出數據遠低於環保署標準。
目前，香港處於流感高發階段，港鐵已于全線採用奈米銀二氧化鈦殺菌劑，港鐵職員亦會在各車站使用一比九十九漂白水加緊清洗。
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